Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms