Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kif1cO35071 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kif1cO35071 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Kif1cO35071 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kif1cO35071 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kif1cO35071 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kif1cO35071 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kif1cO35071 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms