Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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