Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sypl1O09117 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms