Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MttpO08601 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MttpO08601 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MttpO08601 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MttpO08601 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MttpO08601 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MttpO08601 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MttpO08601 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MttpO08601 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MttpO08601 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MttpO08601 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MttpO08601 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MttpO08601 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MttpO08601 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MttpO08601 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MttpO08601 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MttpO08601 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MttpO08601 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MttpO08601 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MttpO08601 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MttpO08601 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MttpO08601 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MttpO08601 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MttpO08601 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MttpO08601 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MttpO08601 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MttpO08601 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MttpO08601 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MttpO08601 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MttpO08601 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MttpO08601 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MttpO08601 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MttpO08601 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MttpO08601 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MttpO08601 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MttpO08601 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MttpO08601 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MttpO08601 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MttpO08601 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MttpO08601 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MttpO08601 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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MttpO08601 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MttpO08601 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MttpO08601 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MttpO08601 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MttpO08601 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MttpO08601 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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MttpO08601 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MttpO08601 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MttpO08601 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MttpO08601 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MttpO08601 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MttpO08601 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MttpO08601 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MttpO08601 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MttpO08601 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MttpO08601 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MttpO08601 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MttpO08601 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MttpO08601 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MttpO08601 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MttpO08601 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MttpO08601 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MttpO08601 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MttpO08601 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms