Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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