Protein–RNA interactions for Protein: L7N298

Gm3424, Predicted gene 3424, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3424L7N298 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3424L7N298 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms