Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm6871L7N248 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms