Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20878L7N244 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm20878L7N244 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms