Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2888K7N746 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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