Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ccdc180J3QNE4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc180J3QNE4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms