Protein–RNA interactions for Protein: J3QN84

Gm21812, Predicted gene, 21812, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21812J3QN84 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21812J3QN84 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms