Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3336J3QMQ6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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