Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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