Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms