Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Farp1F8VPU2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Farp1F8VPU2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms