Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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