Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
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Gm28038F7BCN9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Gm28038F7BCN9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Gm28038F7BCN9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Gm28038F7BCN9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Gm28038F7BCN9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Gm28038F7BCN9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Gm28038F7BCN9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm28038F7BCN9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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