Protein–RNA interactions for Protein: F6URP1

Gm6619, Predicted gene 6619, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6619F6URP1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms