Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm340F6RGI3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm340F6RGI3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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