Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm29094F6Q785 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm29094F6Q785 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm29094F6Q785 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm29094F6Q785 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm29094F6Q785 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm29094F6Q785 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm29094F6Q785 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm29094F6Q785 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm29094F6Q785 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm29094F6Q785 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm29094F6Q785 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm29094F6Q785 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm29094F6Q785 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm29094F6Q785 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm29094F6Q785 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm29094F6Q785 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm29094F6Q785 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm29094F6Q785 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm29094F6Q785 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm29094F6Q785 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm29094F6Q785 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm29094F6Q785 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm29094F6Q785 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm29094F6Q785 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29094F6Q785 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms