Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf4E9QAP7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms