Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DspE9Q557 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DspE9Q557 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DspE9Q557 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DspE9Q557 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DspE9Q557 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DspE9Q557 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DspE9Q557 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DspE9Q557 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DspE9Q557 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DspE9Q557 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms