Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcc4E9Q236 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcc4E9Q236 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcc4E9Q236 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcc4E9Q236 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcc4E9Q236 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcc4E9Q236 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcc4E9Q236 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms