Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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