Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Ccdc171E9Q1U1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Ccdc171E9Q1U1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Ccdc171E9Q1U1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Ccdc171E9Q1U1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc171E9Q1U1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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