Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Zfp558E9Q1J0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Zfp558E9Q1J0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Zfp558E9Q1J0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Zfp558E9Q1J0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp558E9Q1J0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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