Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fndc1E9Q043 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms