Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20425E9Q035 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms