Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ddx60E9PZQ1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx60E9PZQ1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms