Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcom1E9PZ54 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gcom1E9PZ54 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms