Protein–RNA interactions for Protein: E9PX25

Gm4302, Predicted gene 4302, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4302E9PX25 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4302E9PX25 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms