Protein–RNA interactions for Protein: E9PWI7

C87414, Expressed sequence C87414, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87414E9PWI7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C87414E9PWI7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C87414E9PWI7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C87414E9PWI7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C87414E9PWI7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C87414E9PWI7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms