Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms