Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms