Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Gm17333C6EQI3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Gm17333C6EQI3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Gm17333C6EQI3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Gm17333C6EQI3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm17333C6EQI3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gm17333C6EQI3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gm17333C6EQI3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gm17333C6EQI3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gm17333C6EQI3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gm17333C6EQI3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm17333C6EQI3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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