Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmf1B9EKI3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms