Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cttnbp2B9EJA2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms