Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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