Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms