Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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