Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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