Protein–RNA interactions for Protein: B2RT41

Zfc3h1, Zinc finger, C3H1-type-containing, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfc3h1B2RT41 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Zfc3h1B2RT41 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms