Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms