Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ythdc2B2RR83 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms