Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms