Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms