Protein–RNA interactions for Protein: B1AUC4

Ube2u, Ubiquitin-conjugating enzyme E2U (putative), mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2uB1AUC4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2uB1AUC4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ube2uB1AUC4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ube2uB1AUC4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube2uB1AUC4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube2uB1AUC4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube2uB1AUC4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube2uB1AUC4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube2uB1AUC4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube2uB1AUC4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube2uB1AUC4 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube2uB1AUC4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube2uB1AUC4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube2uB1AUC4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube2uB1AUC4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms