Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Trabd2bB1ATG9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Trabd2bB1ATG9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Trabd2bB1ATG9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Trabd2bB1ATG9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Trabd2bB1ATG9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Trabd2bB1ATG9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Trabd2bB1ATG9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trabd2bB1ATG9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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