Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930435E12RikA6X8Z9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms